Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms