Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms