Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms