Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbp4Q00724 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms