Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeleQ00690 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms