Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb4P99026 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb4P99026 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb4P99026 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb4P99026 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb4P99026 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb4P99026 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb4P99026 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb4P99026 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms