Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms