Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
rp9P97762 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
rp9P97762 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
rp9P97762 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
rp9P97762 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
rp9P97762 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms