Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec1P97353 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec1P97353 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms