Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms