Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctps1P70698 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctps1P70698 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctps1P70698 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctps1P70698 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctps1P70698 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms