Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad50P70388 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad50P70388 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms