Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms