Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms