Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms