Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NficP70255 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NficP70255 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NficP70255 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NficP70255 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NficP70255 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms