Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acta1P68134 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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