Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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