Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms