Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms