Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg6P61406 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg6P61406 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg6P61406 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms