Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem258P61166 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms