Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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