Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rin3P59729 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms