Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdrg1P59048 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms