Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms