Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms