Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aqp4P55088 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aqp4P55088 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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