Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb3P54754 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms