Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms