Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DbtP53395 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DbtP53395 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms