Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lbx1P52955 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lbx1P52955 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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