Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TubP50586 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TubP50586 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TubP50586 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms