Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms