Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms