Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms