Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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