Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms