Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbP41155 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LtbP41155 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LtbP41155 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LtbP41155 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbP41155 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LtbP41155 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms