Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd1P40201 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd1P40201 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms