Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik2P39087 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik2P39087 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik2P39087 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik2P39087 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms