Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtlP38585 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtlP38585 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms