Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lig1P37913 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lig1P37913 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms