Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms