Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab23P35288 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms