Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms