Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms