Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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