Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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PtprmP28828 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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