Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms